背景 scp基金会是一个专门收容超自然事物并研究保护人类的机构，里边收容的怪物什么都有，有实体的，对人类造成思想危害的，违背物理学的，存在于宇宙的，能扭曲空间的，毁灭世界的等等等等
其中a级人员是管理层研究员等等，他们的研究属于机密。d级人员一般是死刑犯，用于对scp们为对象做实验的小白鼠。保安是拿着枪弹穿着防弹衣的警卫。
主角1醒来，发现自己是在监狱里的d级人员，他被派去看管scp173的房间里打扫卫生。scp173是一个会移动的钢筋混凝土雕像，在人看它时，它不动，没有人的目光注视它时它会高速移动并扭断人的脖子。主角被派去看着173并轮流与其他3个d级人员眨眼以此控制173，另一个人去打扫卫生。
结果突然灯灭了。173瞬间杀死了房内的3个人，主角跑出了房间，173又瞬间解决了几个警卫，主角关了门
之后主角在逃跑的路上遇到了scp079的房间并通过一张门卡走了进去。
079是一台智能电脑，它有自己的思维，是它控制了基金会这个收容站点的部分电子设备，如电网，闸门，旁边的水坝。主角与079对话，明白了地图的一些构造和机关，以及躲避scp173 scp106(一个会穿墙，满身硫酸的人形怪物) scp 6257(一个悬浮且高速飞行的钢笔，会像子弹一样穿过人的大脑)
的方法。他开始与scp和安保人员们一边逃生一边斗智斗勇，一些封印在房间里的scp他不知道是什么的情况下都不动。后来他知道基地内75个scp都收容失效了，他们破门而出，无论是水杯，衣架，蓝光，生化怪物，病毒，洋娃娃，雕像，毒性气体，机器人，都大开杀戒，于是上层决定用核弹炸掉这个站点，他还有2个小时逃出这个地狱。
这时，他想起自己为什么会失忆，如果他是杀人犯，他会记得，可他什么都不知道，终于在一间房间内找到了自己的身世，他原来是一个研究员，但在违背了上级规定研究出螺旋塔定理并激怒了一个scp使10个重要人员丧命而被降为d级，他们消除了他的记忆。他对物理学的见解，与几个学者的观点不同，他认为世界就是多维的，只要有定义的物理量都可以成为一个维度，所有scp背离不了这个原则。可是他的数据和理论贡献却在几条人命的背负下化为泡影。他们不关心d级的死活，因为哪些人是没有人权的杀人犯或精神病。他们只关心正常人和重要人员的死活，他被降为d级，相当于死了，因为大门已经封锁，他们所有人都会被核弹炸死。
他绝望了，也醒悟了，曾经的宇宙数学难题变为如何生存，保住肉身。如果不是这个门卡(也是一个道具类的scp)，他根本不知道这一切就死了，他不恨谁，他只是想念这阴暗地狱外的美丽世界，他的人生十几年都待在密不透风的实验室里，和妻子儿女告别时也是说是秘密工作，几年就会来，结果却是被一帮没有人性的家伙给背叛了，可怕的不是异常们，可怕的是你们这些人啊！他愤怒，又明白这些怂包早逃之夭夭了，最近的粒子加速器和时间机器也在几公里外，他只好认命
最终，主角在机智的与几个异常斗智斗勇中巧妙地利用科技力量和别的scp的力量杀死了其中3个scp最后牺牲了。